文献资料是贯穿整个写论文的过程中的，所以，大学开设的文献检索课也要贯穿在写论文的过程中。下面让我们看看文献检索课对写论文两个环节的指导性表现在什么地方。
毕业论文指导是最重要的环节。毕业论文中涉及专业内容部分，可能文献检索课教师不太懂，应由专业老师负责。除此之外的内容（如文献检索、文献综述、论文格式、参考文献等等）是文献检索课的强项。因此，撰写毕业论文阶段可充分体现文献检索课的价值所在。
文献检索教师要主动参与毕业论文指导，在学生遇到问题的时候可及时得到老师的解答。文献检索课教师可采用加入学生班级的QQ群，或集中时间在教室现场指导，或者两者相结合等方式，对毕业论文进行实时指导、建议和审查，保证学生的毕业论文达到起点高、格式规范、参考文献著录规范等要求，而这些都是优秀毕业论文的基本条件。因此，通过文献检索课使学生的毕业论文成绩上一个台阶是完全能做到的。
参考文献是问题最多的一个环节。参考文献的全称是文后参考文献，是论文写作中出问题最多的环节。论文是学者的学术成果，所有不注明出处的内容，都应该是自己的东西，不能把别人的东西说成自己的东西。
为此，国家制订了《文后参考文献著录规则》来规范，目的是区分论文中哪些成果是前人的，哪些成果是自己的。按国际通用做法：在论文涉及到已有成果的地方，不去重抄已有的成果，而是指出登载这个成果文献的出处，这种做法叫做引用参考文献。引用了参考文献，就要在涉及前人成果的地方做一个标记，读者见到这个标记，就知道在这里引用了参考文献，按照这个标记，在参考文献列表中就能找到刊登这个成果的详细内容的文章，以便追溯原文。
引用文献必须著录，这是每个人应遵循的学术道德规范，应该避免涉嫌抄袭、剽窃等学术不端行为发生。被列入的参考文献应该只限于那些亲自阅读过、论文中引用过，且正式发表的出版物；引用论点必须准确无误，不能断章取义。